Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpm3Q5F4S9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpm3Q5F4S9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms