Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTN8

Jakmip3, Janus kinase and microtubule-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jakmip3Q5DTN8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jakmip3Q5DTN8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jakmip3Q5DTN8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jakmip3Q5DTN8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Jakmip3Q5DTN8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Jakmip3Q5DTN8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jakmip3Q5DTN8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms