Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spire1Q52KF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms