Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1nQ497L1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1nQ497L1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2al1nQ497L1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1nQ497L1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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