Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc110Q3V125 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms