Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TceancQ3US16 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TceancQ3US16 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms