Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd27Q3UMR0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms