Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms