Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp19Q3UJD6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms