Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dtx3lQ3UIR3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx3lQ3UIR3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms