Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms