Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmd1Q3TXS7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd1Q3TXS7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms