Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc28Q3TX51 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms