Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccndbp1Q3TVC7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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