Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc27Q3TKY6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms