Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms