Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cers3Q1A3B0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cers3Q1A3B0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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