Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms