Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab42Q0PD08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms