Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kndc1Q0KK55 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms