Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcnt1Q09324 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcnt1Q09324 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcnt1Q09324 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms