Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cass4Q08EC4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms