Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssrp1Q08943 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms