Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms