Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MestQ07646 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MestQ07646 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MestQ07646 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MestQ07646 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MestQ07646 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MestQ07646 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MestQ07646 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MestQ07646 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MestQ07646 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MestQ07646 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MestQ07646 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MestQ07646 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MestQ07646 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MestQ07646 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms