Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms