Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddr1Q03146 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms