Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkczQ02956 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms