Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23aQ01405 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms