Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms