Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms