Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms