Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms