Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfdP97946 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfdP97946 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms