Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp1P97350 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms