Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncoa1P70365 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ncoa1P70365 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncoa1P70365 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms