Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx3P70354 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx3P70354 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx3P70354 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx3P70354 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx3P70354 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms