Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Aup1P70295 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aup1P70295 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aup1P70295 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms