Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms