Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chl1P70232 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chl1P70232 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chl1P70232 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chl1P70232 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chl1P70232 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms