Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcbP68404 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcbP68404 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms