Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabrb3P63080 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrb3P63080 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gabrb3P63080 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gabrb3P63080 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gabrb3P63080 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gabrb3P63080 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrb3P63080 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrb3P63080 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrb3P63080 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms