Protein–RNA interactions for Protein: P63028

Tpt1, Translationally-controlled tumor protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpt1P63028 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpt1P63028 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpt1P63028 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpt1P63028 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpt1P63028 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpt1P63028 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpt1P63028 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpt1P63028 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms