Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2bP62915 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms