Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vsnl1P62761 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms