Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms