Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga11P61622 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga11P61622 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga11P61622 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga11P61622 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga11P61622 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms