Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3eP60229 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms