Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup43P59235 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms