Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcif1P59114 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms